La Universidad Nacional de Ucayali fue creada mediante el Decreto Ley N.° 22804, promulgado el 18 de diciembre de 1979, iniciando sus actividades académicas bajo la denominación de Universidad Nacional de Pucallpa. Su creación respondió a la necesidad de fortalecer el acceso a la educación superior pública en la Amazonía peruana, contribuyendo a la formación de profesionales y al desarrollo regional.
Posteriormente, la Ley N.° 23261, de fecha 16 de julio de 1981, ratificó su creación, consolidando su personería jurídica y reafirmando su rol dentro del sistema universitario nacional. Más adelante, con la vigencia de la Ley Universitaria N.° 23733, se dispuso el cambio de denominación a Universidad Nacional de Ucayali, fortaleciendo su estructura académica e institucional.
En ese proceso de crecimiento y diversificación académica, la institución amplió progresivamente su oferta formativa, consolidando nuevas facultades y escuelas profesionales, entre ellas la Escuela Profesional de Ingeniería de Sistemas y, posteriormente, la Escuela Profesional de Ingeniería Civil, configurando la actual Facultad de Ingeniería de Sistemas e Ingeniería Civil como una unidad estratégica para la formación científica, tecnológica y profesional.